Em janeiro de 2006, a Força Internacional de Assistência à Segurança (ISAF) foi enviada ao Afeganistão para ajudar os militares dos EUA e do Reino Unido na luta contra os paramilitares islâmicos Talibã. O governo dos Estados Unidos acusou o Taleban de abrigar o chefe da Al-Qaeda, Osama bin Laden, e exigiu sua extradição. A liderança do Taleban se recusou a atender a essa exigência, dizendo que os Estados Unidos não forneceram evidências da culpa de Osama nos ataques de 11 de setembro de 2001.
No final de 2001, a estrutura militar do Taleban estava praticamente destruída e a resistência de seus apoiadores assumiu a forma de um movimento guerrilheiro. Os países ocidentais investiram pesadamente no desenvolvimento da democracia e na estrutura social do Afeganistão. Em 2004, a primeira eleição presidencial do país foi vencida por Hamid Karzai, um político bastante leal ao Ocidente. No entanto, a resistência dos apoiadores do Taleban não foi reprimida. Os guerrilheiros lutaram ferozmente, apesar da esmagadora superioridade militar das ISAF.
A França, como outros membros da aliança, sofreu perdas em equipamentos e mão de obra. Durante os 10 anos de guerra no Afeganistão, 83 soldados foram mortos e várias vezes mais feridos. A decisão de envolver a França na operação militar não foi muito popular entre a população, e relatos de baixas entre os soldados franceses aumentaram o descontentamento com o governo.
Em 20 de janeiro de 2012, na província de Kapisa, um homem com uniforme do exército afegão atirou em 4 e feriu 16 soldados franceses. Depois disso, Nicolas Sarkozy (presidente francês de 2007 a 2012) disse que como o governo afegão não pode garantir a segurança das tropas francesas, a França está suspendendo sua presença militar naquele país. Sarkozy prometeu retirar as tropas do Afeganistão no início de 2014.
Em 2012, François Hollande foi eleito presidente da França, que anunciou um novo plano de retirada do Afeganistão. 2.000 militares serão retirados até o final de 2012, 1.400 permanecem como instrutores e para proteger as instalações sociais. O presidente explicou sua decisão pelo fato de que o perigo dos terroristas diminuiu, a democracia se fortaleceu e o país deve se desenvolver de forma independente. O chefe da república prometeu que a França continuaria a apoiar o Afeganistão, mas de uma forma diferente.
